在日本，公司需要遵循一系列的税务规定进行报税。首先，日本公司需要缴纳的税种主要包括公司税、企业居民税、法人税、所得税、消费税、营业费用税、固定资产税、汽车税、印花税等。其中，公司税是对公司利润征收的税种，企业居民税和法人税则是根据企业规模和收入来计算的。

对于日本公司报税的具体流程，首先需要根据公司的财务报告计算应缴纳的税款。在日本，公司税务申报和税金缴纳分为期中申报缴纳和最终申报缴纳两期。期中申报缴纳是指当公司的会计年度超过6个月时，需要在该会计年度开始之日起计满6个月后，在其后2个月内提交前6个月的税务申报表，并缴纳相应税款。而最终申报缴纳则需要在财务年度结束后2个月内，依据股东大会展示的财务报告为基础，进行税务申报并缴纳相应税金。

此外，如果日本公司没有账户，没有实地经营，在公司成立的前三年都可以做零申报，只需在年审的时候提供注册证书做零申报就可以了。但如果公司离岸经营，即不在日本本土经营，是不用交税的。

需要注意的是，如果日本公司不报税，将会面临严重后果，如被列入工商总局黑名单、无法申请移民、无法领取养老保险、被税务局罚款、出境受限等。因此，对于广大企业来说，在注册日本公司后，需要时刻关注公司的后续维护，完成年检并按时纳税，以便保持公司的正常运营。