日本公司公证认证的费用取决于多个因素，包括公证认证的类型、文件的页数、是否加急处理等。以下是一般的费用范围：

1. 公证费用：公证费用通常根据文件的页数和公证的内容来计算。每页公证费用可能在几十到上百日元不等。

2. 认证费用：外务省的认证费用通常是固定的，每份文件大约在几千日元到一万日元之间。

3. 使馆认证费用：中国驻日本使馆的认证费用也可能在几千日元到一万日元之间，具体金额可能会有所变动。

4. 加急费用：如果选择加急服务，可能会需要额外支付加急费用，费用具体数额可能会因机构而异。

总的来说，日本公司公证认证的总费用可能在几万日元到十几万日元之间。具体数额需要根据实际情况和选择的机构来确定。建议在办理之前咨询具体的公证认证机构，以获取准确的费用信息。