在尼日利亚申请商标注册时，有以下注意事项需要特别关注：

1. 商标显著性：所申请的商标必须具有显著性，不能过于模糊或普通，以便消费者能够轻易地区分和识别。

2. 避免侵犯他人权利：在申请前要进行充分的商标查询，确保所申请的商标不侵犯他人在先的权利，如版权、专利权等。

3. 不支持一标多类：尼日利亚不接受一标多类的申请方式，每个类别必须单独提交申请。

4. 使用要求：商标注册后，如果连续五年未使用，第三方可以提出撤销申请。因此，商标注册后应积极使用并保留使用证据。

5. 优先权问题：虽然尼日利亚是《巴黎公约》的签署国，但目前尚未制定行政命令指定优先权要求适用的相关公约国家。因此，商标注册处不承认来自其他国家的要求优先权的商标申请。

6. 单一国家注册途径：尼日利亚不是马德里体系的成员，因此只能通过单一国家注册的途径进行商标注册。

7. 禁用商标：不得注册会误导公众的具有欺骗性的商标，也应避免使用蓝、白、蓝平行条状图形，因为这种造型类似该国国旗。

8. 提交申请所需材料：申请时需要提交由申请人签署的委托书、商标图样（彩色商标还需提供彩色图样）、商标使用声明以及商标官方查询报告等材料。

9. 审查形式：尼日利亚知识产权局接受商标申请后，会进行形式审查，包括查询是否有在先冲突商标、是否具有显著性等。如果审查通过，商标将在商标期刊上发布，并设有2个月的异议期。

以上是在尼日利亚申请商标注册时需要注意的事项。为确保顺利注册并保护您的商标权益，建议在申请前充分了解相关法规和要求，并考虑咨询专业的知识产权律师或代理机构。