企业进行境外投资备案的流程主要包括以下几个步骤：

1. 确定备案类型：首先，企业需要确定其境外投资项目是属于核准类还是备案类。如果投资项目涉及敏感国家和地区、敏感行业，则需要申请核准；否则，一般属于备案管理范围。

2. 准备申请材料：企业应根据具体要求准备相应的申请材料，包括但不限于：

   - 申请书，详细介绍投资主体情况、境外企业名称、股权结构、投资金额、经营范围等。

   - 《境外投资申请表》或《境外投资备案表》。

   - 境外投资相关合同或协议。

   - 有关部门对境外投资所涉的限制出口产品或技术的出口许可材料。

   - 企业营业执照复印件。

3. 提交申请：企业可以通过“全国境外投资管理和服务网络系统”（ndrc.gov.cn）进行在线申报，并提交电子材料。如果涉及国家秘密或不适宜使用网络系统的事项，可以使用纸质材料提交。

4. 审核流程：对于属于备案情形的境外投资，中央企业报商务部备案，地方企业报所在地省级商务主管部门备案。商务部或省级商务主管部门在收到完整的《备案表》后，如声明无本办法第四条所列情形，应在3个工作日内予以备案并颁发《企业境外投资证书》。

5. 征求意见：对于属于核准情形的境外投资，中央企业向商务部提出申请，地方企业通过所在地省级商务主管部门向商务部提出申请。核准境外投资应当征求我驻外使（领）馆（经商处室）意见。

6. 办理外汇管理等手续：在获得备案通知书或《企业境外投资证书》后，企业还需要根据外汇管理等相关规定，到外汇管理部门办理外汇登记等手续。

7. 后续报告义务：企业在境外投资过程中，如遇重大不利情况或项目完成后，需向备案机关提交相应的报告表。

8. 变更或延期：如果已备案的项目发生变更，如投资额、投资地点等重大变化，企业需向原备案机关提出变更申请；如果需要延长项目有效期，也应提前申请延期。

请注意，以上流程仅供参考，具体操作时应以最新的法律法规和政策为准，并根据企业的实际情况进行调整。同时，企业在办理过程中应确保提供的信息真实、准确、完整，遵守相关法律法规，以免影响备案进程。