在巴西进行商标注册申请，可以按照以下步骤进行：

1. 准备申请文件：需要准备商标图样、申请人身份证明、商标使用声明等申请文件。这些文件需要用葡萄牙文填写，如果非葡萄牙文，需要提供文件的译文。

2. 提交申请：可以通过e-Brands系统在线提交申请，或者通过INPI的线下申请方式提交申请。在提交申请时，需要缴纳申请费用。

3. 形式审查：INPI将对申请进行形式审查，检查申请表格是否填写完整、商标是否符合法律要求等。如果申请表格填写不完整或商标不符合法律要求，INPI将通知申请人进行补正。

4. 实质审查：如果申请通过形式审查，INPI将对商标进行实质审查，包括商标的可注册性、与已有商标的相似性等。这一阶段可能需要更长时间，因为可能需要答复INPI的疑问或提供更多信息。

5. 公告期：如果INPI认为商标符合要求，将会在官方公报上公告商标信息。公告期为60天，期间任何人都可以提出异议。

6. 核准和注册：如果在公告期内没有异议，或者异议被驳回，INPI将核准并注册该商标。此时，将收到商标注册证书，这表明商标所有权受到法律保护。

以上是巴西商标注册申请的一般流程，具体流程可能会根据具体情况和地区差异而有所不同。