在日本注销公司，通常指的是终止公司的法人资格，并完成所有必要的法律程序。这个过程可能因公司的具体情况而有所不同，但一般包括以下几个步骤：

1. 决定解散

召开股东大会：根据日本公司法，需要获得过半数表决权的股东出席，并且出席股东的表决权三分之二以上同意才能通过解散决议。

选任清算人：在决定解散的同时，还需要选定清算人来负责接下来的清算工作。

2. 解散登记

向法务局提交解散登记：从公司决定解散之日起两周内，需向当地法务局提交解散登记申请及清算人选任登记。

缴纳登记许可税：在提交解散登记时，需要支付相应的登记许可税。

3. 向各机关申报解散

税务局、市镇村办事处、社会保险事务所等：在解散登记完成后，需要尽快向这些机关报告公司解散的情况。

4. 制作财产目录和资产负债表

调查公司资产：清算人需要尽快调查公司的财产状况，制作详细的财产目录和资产负债表。

取得股东大会承认：上述文件需得到股东大会的认可后保存。

5. 债权人保护程序

通知债权人：公司应当直接联系已知的债权人，并在官方公报上发布解散通知，设定一个超过两个月的期限接受债权人的索赔。

6. 提交Zui后的纳税申报

税务申报：解散日起两个月内，应提交Zui后一次的纳税申报给税务局。

7. 确定并分配剩余财产

清偿债务：清算人在确认了公司的债权和债务后，首先偿还所有债务。

分配剩余财产：如果公司在清偿完所有债务后还有剩余财产，则将按照股东的出资比例进行分配。

8. 清算确定申告书

向税务局提交清算确定申告书：在剩余财产确定后的1个月内，需要向税务局提交清算确定申告书。如果有清算期间产生的收入，还需缴纳税款。

9. 财务报表批准

财务报表批准：在分配完剩余财产后，清算人需要制作财务报表，并在股东大会上获得批准。

10. 清算结束登记

向法务局提交清算结束登记：财务报表被批准后两周内，需要再次向法务局提交清算结束登记。

11. Zui终报告

向税务局等机关报告清算结束：Zui后一步是向税务局及其他相关机构报告清算已经结束。