在日本办理委托公证认证通常涉及到两个步骤：首先是在日本进行公证，然后进行国际认证。以下是详细步骤：

1. 准备委托书和相关文件：

   - 委托书：需要明确写明委托事项、委托人和被委托人的信息。

   - 身份证明：委托人和被委托人的身份证明文件，如护照。

   - 其他相关文件：根据具体委托事项可能需要提供的文件。

2. 在日本进行公证：

   - 联系日本的公证人（公证所），提交准备好的委托书和相关文件。

   - 公证人会对文件进行审核，确保其真实性和合法性，然后在文件上加盖公证章。

3. 国际认证：

   - 完成公证后，将公证文件提交给日本外务省进行认证。外务省会对公证文件进行审核，并在文件上盖章，以证明其真实性和合法性。

   - 接下来，将经过外务省认证的公证文件提交给中国驻日本使馆进行认证。使馆会对文件进行审核，并在文件上盖章，以证明其真实性和合法性。

4. 等待认证结果：

   - 完成上述步骤后，需要等待认证结果。一般来说，公证认证所需时间为28个工作日左右。如果您有紧急需求，可以选择加急服务，时间将缩短至20个工作日左右。

需要注意的是，中国已于2023年3月正式加入《取消外国公文书认证要求的公约》。根据该公约，成员国之间的文书流转只需办理海牙认证（apostille）即可。因此，在未来，如果《公约》在中国生效实施，您可能只需要办理海牙认证即可。